Apafi Mihály erdélyi fejedelem kancellárja hagyatéklevelet ír: „Én Bethlen János szemem elött viselvén, hogy az Isten a világi mulandó jókban csak sáfárrá tett, keresztyén kötelességünk akarván vékony tehetségem szerént felelni, testamentumomban hattam volt az udvarhelyi orthodoxa scolának 1000 aranyat…”

Az alapítványt nemsokára megerősíti a fejedelem, majd pedig a nagyenyedi zsinat, és elindul történelmi útján egy iskola…

1670 és 1900 között a kollégiumnak 43 gondnoka volt ebből 15 az alapító Bethlen család tagja, a 43. pedig Ugron János Udvarhely megye alispánja.
A tizenöt Bethlen mindegyike adományozó, mecénás. Közülük kettő a leginkább említésre méltó: az egyik gróf Bethlen Dávid, aki 1716-ban „ajándékozott egy nagy pecsétnyomót a kollégium számára, amelynek lapján egy rózsabokor van bevésve és körül e szavak :„Per spinas ad rosas”.

A kollégium történetének első 250 éves szakasza 1926-ban zárul. Ez időszakban kialakult az iskola sajátos arcéle: falai közül a magyar kultúra olyan neves egyéniségei kerültek ki, mint Orbán Balázs és Benedek Elek.

Az 1927-1927-as tanévvel új fejezet kezdődik az iskola történetében. A Kolozsváron tartott 1927-es egyházkerületi közgyűlés úgy határozott, hogy a kollégium – főgimnázium működését bizonytalan időre felfüggeszti és helyébe Nagyenyedről áthelyezi az ott 1917-ben létesült református tanítóképzőt. 1948-ig az iskola megőrzi felekezeti jellegét és a református szellemiségét.

Az 1989-es fordulat lehetőséget adott arra is, hogy az iskolák kiléphessenek a korábbi névtelenségből és felvegyék valamely híres személyiség nevét.
Az iskola 1990. december 8-án egykori tanulójának, a nagy mesemondónak a nevét veszi fel, így mindmáig a Benedek Elek Tanítóképző nevet viseli. Szabó János szobrászművész elkészíti a Benedek Elek mellszobrot, amelynek a leleplezésénél, az iskola volt tanulója, Kányádi SándorHerder-díjas költő, méltatta Elek apó munkásságát.
Az 1994-ben újraindult és és 2001-től önállósult Református Gimnázium felvette a “Baczkamadarasi Kis Gergely” nevet, a volt Kollégium egykori híres iskola- és templomépítő személyiségének a nevét.